using the EnsembleSmootherPipeline instead of Main for clarity in naming scheme

das.py

@@ -19,13 +19,12 @@ import os
 dummy = sys.path.append(os.getcwd())
 
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-# Next, import the tools needed to initialize a data assimilation cycle, as well as the pipeline (Main())
+# Next, import the tools needed to initialize a data assimilation cycle
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 from da.tools.initexit import StartLogger
 from da.tools.initexit import ValidateOptsArgs
 from da.tools.initexit import ParseOptions
-from da.tools.pipeline import Main
 
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 # Parse and validate the command line options, start logging
@@ -47,6 +46,7 @@ DaCycle     = CycleControl(opts,args)
 ### IMPORT THE APPLICATION SPECIFIC MODULES HERE, TO BE PASSED INTO THE MAIN PIPELINE!!! ##
 ###########################################################################################
 
+from da.tools.pipeline import EnsembleSmootherPipeline
 from da.platform.maunaloa import MaunaloaPlatForm 
 from da.ct.dasystem import CtDaSystem 
 from da.ct.statevector import CtStateVector 
@@ -70,7 +70,7 @@ print "\n    *******************************************************************
 print "    ***************************************   Entering Pipeline   ******************************************"
 print "    ********************************************************************************************************\n"
 
-Main(DaCycle,PlatForm, DaSystem, Samples,StateVector,ObsOperator,Optimizer)
+EnsembleSmootherPipeline(DaCycle,PlatForm, DaSystem, Samples,StateVector,ObsOperator,Optimizer)
 
 
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