diff --git a/docs/details_nbt/details_mnp_soorten.md b/docs/details_nbt/details_mnp_soorten.md new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..4ab64d6916768190920def1103b985bc529e2325 --- /dev/null +++ b/docs/details_nbt/details_mnp_soorten.md @@ -0,0 +1,475 @@ +Hieronder een tabel met alle courante soorten voor MNP. De tabel bevat **468** soorten: **35** vlinders, **107** vogels en **326** planten. De Soortcode is opgemaakt voor gebruik in MNP (beginnend met `S0`). De laatste getallen van de code zijn vergelijkbaar met de code uit de [CBS BioBase naamlijst](https://www.cbs.nl/nl-nl/onze-diensten/methoden/classificaties/overig/biobase-2003/naamlijst-biobase). Deze tabel is gebasseerd op `\qmar\MNP-SNL-ParameterSet\Parameters_v06_2019_12_09\09_MNP_versie4_Group_Species_valid model_468.csv` + +|volgnummer|Species_code|Scientific_name|Local_name|Taxon_group| +|---|---------|------------------------|--------------------|---------------| +|1|S06000012|Pyrgus malvae|Aardbeivlinder|Dagvlinder| +|2|S06000092|Lasiommata megera|Argusvlinder|Dagvlinder| +|3|S06000002|Carterocephalus palaemon|Bont dikkopje|Dagvlinder| +|4|S06000052|Aricia agestis|Bruin blauwtje|Dagvlinder| +|5|S06000008|Erynnis tages|Bruin dikkopje|Dagvlinder| +|6|S06000101|Maniola jurtina|Bruin zandoogje|Dagvlinder| +|7|S06000044|Lycaena tityrus|Bruine vuurvlinder|Dagvlinder| +|8|S06000062|Maculinea nausithous|Donker pimpernelblauwtje|Dagvlinder| +|9|S06000082|Argynnis niobe|Duinparelmoervlinder|Dagvlinder| +|10|S06000003|Thymelicus sylvestris|Geelsprietdikkopje|Dagvlinder| +|11|S06000057|Maculinea alcon|Gentiaanblauwtje|Dagvlinder| +|12|S06000035|Callophrys rubi|Groentje|Dagvlinder| +|13|S06000007|Ochlodes faunus|Groot dikkopje|Dagvlinder| +|14|S06000065|Limenitis populi|Grote ijsvogelvlinder|Dagvlinder| +|15|S06000084|Argynnis aglaja|Grote parelmoervlinder|Dagvlinder| +|16|S06000042|Lycaena dispar|Grote vuurvlinder|Dagvlinder| +|17|S06000066|Apatura iris|Grote weerschijnvlinder|Dagvlinder| +|18|S06000049|Plebeius argus|Heideblauwtje|Dagvlinder| +|19|S06000106|Hipparchia semele|Heivlinder|Dagvlinder| +|20|S06000098|Coenonympha pamphilus|Hooibeestje|Dagvlinder| +|21|S06000107|Hipparchia statilinus|Kleine heivlinder|Dagvlinder| +|22|S06000064|Limenitis camilla|Kleine ijsvogelvlinder|Dagvlinder| +|23|S06000081|Issoria lathonia|Kleine parelmoervlinder|Dagvlinder| +|24|S06000006|Hesperia comma|Kommavlinder|Dagvlinder| +|25|S06000019|Anthocharis cardamines|Koninginnenpage|Dagvlinder| +|26|S06000061|Maculinea teleius|Pimpernelblauwtje|Dagvlinder| +|27|S06000080|Brenthis ino|Purperstreepparelmoervlinder|Dagvlinder| +|28|S06000097|Coenonympha arcania|Tweekleurig hooibeestje|Dagvlinder| +|29|S06000050|Plebeius idas ssp. idas|Vals heideblauwtje|Dagvlinder| +|30|S06000051|Plebeius optilete|Veenbesblauwtje|Dagvlinder| +|31|S06000076|Boloria aquilonaris|Veenbesparelmoervlinder|Dagvlinder| +|32|S06000099|Coenonympha tullia ssp. tullia|Veenhooibeestje|Dagvlinder| +|33|S06000088|Melitaea cinxia|Veldparelmoervlinder|Dagvlinder| +|34|S06000077|Boloria selene|Zilveren maan|Dagvlinder| +|35|S06000004|Thymelicus lineola|Zwartsprietdikkopje|Dagvlinder| +|36|S09001011|Potentilla sterilis|Aardbeiganzerik|Vaatplant| +|37|S09000330|Cirsium acaule|Aarddistel|Vaatplant| +|38|S09000169|Bunium bulbocastanum|Aardkastanje|Vaatplant| +|39|S09001243|Stachys arvensis|Akkerandoorn|Vaatplant| +|40|S09001042|Ranunculus arvensis|Akkerboterbloem|Vaatplant| +|41|S09000072|Misopates orontium|Akkerleeuwenbek|Vaatplant| +|42|S09000327|Circaea alpina|Alpenheksenkruid|Vaatplant| +|43|S09000491|Euphorbia amygdaloides|Amandelwolfsmelk|Vaatplant| +|44|S09000438|Eleocharis quinqueflora|Armbloemige waterbies|Vaatplant| +|45|S09000603|Helictotrichon pratense|Beemdhaver|Vaatplant| +|46|S09000692|Knautia arvensis|Beemdkroon|Vaatplant| +|47|S09000858|Narthecium ossifragum|Beenbreek|Vaatplant| +|48|S09000157|Bromopsis erecta|Bergdravik|Vaatplant| +|49|S09000951|Platanthera montana|Bergnachtorchis|Vaatplant| +|50|S09000575|Geranium pyrenaicum|Bermooievaarsbek|Vaatplant| +|51|S09000377|Cucubalus baccifer|Besanjelier|Vaatplant| +|52|S09001244|Stachys officinalis|Betonie|Vaatplant| +|53|S09000153|Briza media|Bevertjes|Vaatplant| +|54|S09000444|Elytrigia juncea subsp. boreoatlantica|Biestarwegras|Vaatplant| +|55|S09000642|Hyoscyamus niger|Bilzekruid|Vaatplant| +|56|S09000902|Orobanche picridis|Bitterkruidbremraap|Vaatplant| +|57|S09000389|Cystopteris fragilis|Blaasvaren|Vaatplant| +|58|S09001024|Puccinellia fasciculata|Blauw kweldergras|Vaatplant| +|59|S09001198|Sherardia arvensis|Blauw walstro|Vaatplant| +|60|S09000903|Orobanche purpurea|Blauwe bremraap|Vaatplant| +|61|S09001258|Succisa pratensis|Blauwe knoop|Vaatplant| +|62|S09000486|Eryngium maritimum|Blauwe zeedistel|Vaatplant| +|63|S09000289|Cephalanthera damasonium|Bleek bosvogeltje|Vaatplant| +|64|S09000044|Alyssum alyssoides|Bleek schildzaad|Vaatplant| +|65|S09000541|Galeopsis segetum|Bleekgele hennepnetel|Vaatplant| +|66|S09000247|Carex pallescens|Bleke zegge|Vaatplant| +|67|S09000236|Carex hostiana|Blonde zegge|Vaatplant| +|68|S09001302|Trifolium medium|Bochtige klaver|Vaatplant| +|69|S09000015|Agrostemma githago|Bolderik|Vaatplant| +|70|S09000471|Equisetum variegatum|Bonte paardenstaart|Vaatplant| +|71|S09000857|Nardus stricta|Borstelgras|Vaatplant| +|72|S09001143|Clinopodium vulgare|Borstelkrans|Vaatplant| +|73|S09000529|Fragaria vesca|Bosaardbei|Vaatplant| +|74|S09000588|Gnaphalium sylvaticum|Bosdroogbloem|Vaatplant| +|75|S09001354|Veronica montana|Bosereprijs|Vaatplant| +|76|S09001253|Stellaria nemorum|Bosmuur|Vaatplant| +|77|S09000781|Lysimachia nemorum|Boswederik|Vaatplant| +|78|S09001415|Polypodium interjectum|Brede eikvaren|Vaatplant| +|79|S09001364|Veronica austriaca subsp. teucrium|Brede ereprijs|Vaatplant| +|80|S09000886|Dactylorhiza majalis subsp. majalis|Brede orchis|Vaatplant| +|81|S09000695|Koeleria pyramidata|Breed fakkelgras|Vaatplant| +|82|S09000478|Eriophorum latifolium|Breed wollegras|Vaatplant| +|83|S09001069|Rhynchospora fusca|Bruine snavelbies|Vaatplant| +|84|S09000643|Hypericum canadense|Canadees hertshooi|Vaatplant| +|85|S09000008|Actaea spicata|Christoffelkruid|Vaatplant| +|86|S09000492|Euphorbia cyparissias|Cipreswolfsmelk|Vaatplant| +|87|S09000034|Allium ursinum|Daslook|Vaatplant| +|88|S09000590|Goodyera repens|Dennenorchis|Vaatplant| +|89|S09001356|Veronica opaca|Doffe ereprijs|Vaatplant| +|90|S09000663|Inula conyzae|Donderkruid|Vaatplant| +|91|S09001386|Viola reichenbachiana|Donkersporig bosviooltje|Vaatplant| +|92|S09000324|Cicendia filiformis|Draadgentiaan|Vaatplant| +|93|S09001303|Trifolium micranthum|Draadklaver|Vaatplant| +|94|S09000681|Juncus filiformis|Draadrus|Vaatplant| +|95|S09000239|Carex lasiocarpa|Draadzegge|Vaatplant| +|96|S09000164|Bromus secalinus|Dreps|Vaatplant| +|97|S09000269|Carlina vulgaris|Driedistel|Vaatplant| +|98|S09001162|Schoenoplectus triqueter|Driekantige bies|Vaatplant| +|99|S09000266|Carex trinervis|Drienervige zegge|Vaatplant| +|100|S09001228|Sparganium angustifolium|Drijvende egelskop|Vaatplant| +|101|S09000765|Luronium natans|Drijvende waterweegbree|Vaatplant| +|102|S09000937|Picris echioides|Dubbelkelk|Vaatplant| +|103|S09000146|Blechnum spicant|Dubbelloof|Vaatplant| +|104|S09001147|Scabiosa columbaria|Duifkruid|Vaatplant| +|105|S09000672|Juncus alpinoarticulatus subsp. atricapillus|Duinrus|Vaatplant| +|106|S09000567|Gentianella germanica|Duitse gentiaan|Vaatplant| +|107|S09000917|Parapholis strigosa|Dunstaart|Vaatplant| +|108|S09000288|Centunculus minimus|Dwergbloem|Vaatplant| +|109|S09000686|Juncus pygmaeus|Dwergrus|Vaatplant| +|110|S09000524|Filago minima|Dwergviltkruid|Vaatplant| +|111|S09001038|Radiola linoides|Dwergvlas|Vaatplant| +|112|S09000343|Cochlearia officinalis subsp. officinalis|Echt lepelblad|Vaatplant| +|113|S09001222|Solidago virgaurea|Echte guldenroede|Vaatplant| +|114|S09000479|Eriophorum vaginatum|Eenarig wollegras|Vaatplant| +|115|S09000920|Paris quadrifolia|Eenbes|Vaatplant| +|116|S09000808|Melica uniflora|Eenbloemig parelgras|Vaatplant| +|117|S09000744|Kickxia spuria|Eironde leeuwenbek|Vaatplant| +|118|S09000091|Armeria maritima|Engels gras|Vaatplant| +|119|S09000341|Cochlearia officinalis subsp. anglica|Engels lepelblad|Vaatplant| +|120|S09000170|Bupleurum tenuissimum|Fijn goudscherm|Vaatplant| +|121|S09000569|Geranium columbinum|Fijne ooievaarsbek|Vaatplant| +|122|S09000650|Hypericum pulchrum|Fraai hertshooi|Vaatplant| +|123|S09000565|Gentianella ciliata|Franjegentiaan|Vaatplant| +|124|S09000337|Cladium mariscus|Galigaan|Vaatplant| +|125|S09001319|Ulex europaeus|Gaspeldoorn|Vaatplant| +|126|S09001923|Helianthemum nummularium|Geel zonneroosje|Vaatplant| +|127|S09000747|Linum catharticum|Geelhartje|Vaatplant| +|128|S09000321|Glebionis segetum|Gele ganzenbloem|Vaatplant| +|129|S09000233|Carex flava|Gele zegge|Vaatplant| +|130|S09000148|Botrychium lunaria|Gelobde maanvaren|Vaatplant| +|131|S09000124|Atriplex laciniata|Gelobde melde|Vaatplant| +|132|S09001473|Festuca ovina|Genaald schapengras|Vaatplant| +|133|S09000432|Elatine hexandra|Gesteeld glaskroos|Vaatplant| +|134|S09000595|Atriplex pedunculata|Gesteelde zoutmelde|Vaatplant| +|135|S09001308|Trifolium striatum|Gestreepte klaver|Vaatplant| +|136|S09001335|Valerianella dentata|Getande veldsla|Vaatplant| +|137|S09001313|Tuberaria guttata|Gevlekt zonneroosje|Vaatplant| +|138|S09001616|Dactylorhiza maculata|Gevlekte orchis|Vaatplant| +|139|S09000013|Agrimonia eupatoria|Gewone agrimonie|Vaatplant| +|140|S09000963|Polygala vulgaris|Gewone vleugeltjesbloem|Vaatplant| +|141|S09000652|Hypochaeris glabra|Glad biggenkruid|Vaatplant| +|142|S09001312|Trisetum flavescens|Goudhaver|Vaatplant| +|143|S09000713|Lathyrus nissolia|Graslathyrus|Vaatplant| +|144|S09000748|Liparis loeselii|Groenknolorchis|Vaatplant| +|145|S09000659|Illecebrum verticillatum|Grondster|Vaatplant| +|146|S09000721|Legousia speculum-veneris|Groot spiegelklokje|Vaatplant| +|147|S09000284|Centaurea scabiosa|Grote centaurie|Vaatplant| +|148|S09000750|Neottia ovata|Grote keverorchis|Vaatplant| +|149|S09000074|Aphanes arvensis|Grote leeuwenklauw|Vaatplant| +|150|S09000593|Gymnadenia conopsea|Grote muggenorchis|Vaatplant| +|151|S09001283|Thymus pulegioides|Grote tijm|Vaatplant| +|152|S09000771|Luzula sylvatica|Grote veldbies|Vaatplant| +|153|S09000775|Lycopodium clavatum|Grote wolfsklauw|Vaatplant| +|154|S09001015|Primula veris|Gulden sleutelbloem|Vaatplant| +|155|S09001365|Veronica triphyllos|Handjesereprijs|Vaatplant| +|156|S09000889|Orchis morio|Harlekijn|Vaatplant| +|157|S09000633|Holosteum umbellatum|Heelbeen|Vaatplant| +|158|S09001138|Sanicula europaea|Heelkruid|Vaatplant| +|159|S09000043|Althaea officinalis|Heemst|Vaatplant| +|160|S09000924|Pedicularis sylvatica|Heidekartelblad|Vaatplant| +|161|S09000230|Carex ericetorum|Heidezegge|Vaatplant| +|162|S09001240|Spiranthes spiralis|Herfstschroeforchis|Vaatplant| +|163|S09000345|Colchicum autumnale|Herfsttijloos|Vaatplant| +|164|S09000051|Anacamptis pyramidalis|Hondskruid|Vaatplant| +|165|S09001380|Viola canina|Hondsviooltje|Vaatplant| +|166|S09000608|Herminium monorchis|Honingorchis|Vaatplant| +|167|S09000691|Juniperus communis|Jeneverbes|Vaatplant| +|168|S09001454|Alchemilla glabra|Kale vrouwenmantel|Vaatplant| +|169|S09000553|Galium pumilum|Kalkwalstro|Vaatplant| +|170|S09000386|Cynosurus cristatus|Kamgras|Vaatplant| +|171|S09000271|Carum carvi|Karwij|Vaatplant| +|172|S09001182|Selinum carvifolia|Karwijselie|Vaatplant| +|173|S09000928|Peucedanum carvifolia|Karwijvarkenskervel|Vaatplant| +|174|S09000877|Ononis repens subsp. spinosa|Kattendoorn|Vaatplant| +|175|S09000901|Orobanche minor|Klavervreter|Vaatplant| +|176|S09001324|Utricularia minor|Klein blaasjeskruid|Vaatplant| +|177|S09001174|Scutellaria minor|Klein glidkruid|Vaatplant| +|178|S09001232|Spartina maritima|Klein slijkgras|Vaatplant| +|179|S09000379|Cuscuta epithymum|Klein warkruid|Vaatplant| +|180|S09001033|Pyrola minor|Klein wintergroen|Vaatplant| +|181|S09000668|Isoetes echinospora|Kleine biesvaren|Vaatplant| +|182|S09000749|Neottia cordata|Kleine keverorchis|Vaatplant| +|183|S09000234|Carex hartmanii|Kleine knotszegge|Vaatplant| +|184|S09001067|Rhinanthus minor|Kleine ratelaar|Vaatplant| +|185|S09001953|Thalictrum minus|Kleine ruit|Vaatplant| +|186|S09000800|Medicago minima|Kleine rupsklaver|Vaatplant| +|187|S09001166|Scorzonera humilis|Kleine schorseneer|Vaatplant| +|188|S09001141|Clinopodium acinos|Kleine steentijm|Vaatplant| +|189|S09001284|Thymus serpyllum|Kleine tijm|Vaatplant| +|190|S09001332|Valeriana dioica|Kleine valeriaan|Vaatplant| +|191|S09000913|Vaccinium oxycoccos|Kleine veenbes|Vaatplant| +|192|S09000776|Lycopodium tristachyum|Kleine wolfsklauw|Vaatplant| +|193|S09000494|Euphorbia exigua|Kleine wolfsmelk|Vaatplant| +|194|S09000417|Drosera intermedia|Kleine zonnedauw|Vaatplant| +|195|S09001230|Sparganium natans|Kleinste egelskop|Vaatplant| +|196|S09000481|Erodium lebelii|Kleverige reigersbek|Vaatplant| +|197|S09000568|Gentiana pneumonanthe|Klokjesgentiaan|Vaatplant| +|198|S09000191|Campanula glomerata|Kluwenklokje|Vaatplant| +|199|S09000578|Geum rivale|Knikkend nagelkruid|Vaatplant| +|200|S09000711|Lathyrus linifolius|Knollathyrus|Vaatplant| +|201|S09001144|Saxifraga granulata|Knolsteenbreek|Vaatplant| +|202|S09000039|Alopecurus bulbosus|Knolvossenstaart|Vaatplant| +|203|S09001150|Schoenus nigricans|Knopbies|Vaatplant| +|204|S09001290|Torilis nodosa|Knopig doornzaad|Vaatplant| +|205|S09000217|Carex buxbaumii|Knotszegge|Vaatplant| +|206|S09000279|Centaurea cyanus|Korenbloem|Vaatplant| +|207|S09000094|Arnoseris minima|Korensla|Vaatplant| +|208|S09001130|Salvia verticillata|Kranssalie|Vaatplant| +|209|S09000966|Polygonatum verticillatum|Kranssalomonszegel|Vaatplant| +|210|S09000560|Genista pilosa|Kruipbrem|Vaatplant| +|211|S09000430|Baldellia ranunculoides subsp. repens|Kruipende moerasweegbree|Vaatplant| +|212|S09000566|Gentiana cruciata|Kruisbladgentiaan|Vaatplant| +|213|S09000548|Cruciata laevipes|Kruisbladwalstro|Vaatplant| +|214|S09000961|Polygala comosa|Kuifvleugeltjesbloem|Vaatplant| +|215|S09000231|Carex extensa|Kwelderzegge|Vaatplant| +|216|S09000275|Catapodium marinum|Laksteeltje|Vaatplant| +|217|S09000738|Limonium vulgare|Lamsoor|Vaatplant| +|218|S09000416|Drosera longifolia|Lange zonnedauw|Vaatplant| +|219|S09000055|Andromeda polifolia|Lavendelhei|Vaatplant| +|220|S09000105|Asparagus officinalis subsp. prostratus|Liggende asperge|Vaatplant| +|221|S09001361|Veronica prostrata|Liggende ereprijs|Vaatplant| +|222|S09000962|Polygala serpyllifolia|Liggende vleugeltjesbloem|Vaatplant| +|223|S09000887|Orchis mascula|Mannetjesorchis|Vaatplant| +|224|S09001389|Viola persicifolia|Melkviooltje|Vaatplant| +|225|S09000092|Armoracia rusticana|Mierik|Vaatplant| +|226|S09000456|Epilobium palustre|Moerasbasterdwederik|Vaatplant| +|227|S09000644|Hypericum elodes|Moerashertshooi|Vaatplant| +|228|S09000923|Pedicularis palustris|Moeraskartelblad|Vaatplant| +|229|S09001265|Taraxacum palustre|Moeraspaardenbloem|Vaatplant| +|230|S09000399|Deschampsia setacea|Moerassmele|Vaatplant| +|231|S09000373|Crepis paludosa|Moerasstreepzaad|Vaatplant| +|232|S09000461|Epipactis palustris|Moeraswespenorchis|Vaatplant| +|233|S09000777|Lycopodiella inundata|Moeraswolfsklauw|Vaatplant| +|234|S09000496|Euphorbia palustris|Moeraswolfsmelk|Vaatplant| +|235|S09000031|Allium oleraceum|Moeslook|Vaatplant| +|236|S09002417|Hieracium murorum|Muurhavikskruid|Vaatplant| +|237|S09000710|Lathyrus aphaca|Naakte lathyrus|Vaatplant| +|238|S09001148|Scandix pecten-veneris|Naaldenkervel|Vaatplant| +|239|S09000806|Silene noctiflora|Nachtkoekoeksbloem|Vaatplant| +|240|S09000214|Carex aquatilis|Noordse zegge|Vaatplant| +|241|S09000753|Littorella uniflora|Oeverkruid|Vaatplant| +|242|S09001309|Trifolium subterraneum|Onderaardse klaver|Vaatplant| +|243|S09000077|Apium inundatum|Ondergedoken moerasscherm|Vaatplant| +|244|S09000993|Potamogeton gramineus|Ongelijkbladig fonteinkruid|Vaatplant| +|245|S09001205|Silene otites|Oorsilene|Vaatplant| +|246|S09001263|Taraxacum obliquum|Oranjegele paardenbloem|Vaatplant| +|247|S09001164|Scleranthus perennis|Overblijvende hardbloem|Vaatplant| +|248|S09000323|Chrysosplenium oppositifolium|Paarbladig goudveil|Vaatplant| +|249|S09000213|Carex appropinquata|Paardenhaarzegge|Vaatplant| +|250|S09000921|Parnassia palustris|Parnassia|Vaatplant| +|251|S09000939|Pilularia globulifera|Pilvaren|Vaatplant| +|252|S09001323|Utricularia intermedia|Plat blaasjeskruid|Vaatplant| +|253|S09001157|Blysmus compressus|Platte bies|Vaatplant| +|254|S09000817|Mentha pulegium|Polei|Vaatplant| +|255|S09000891|Orchis purpurea|Purperorchis|Vaatplant| +|256|S09000196|Campanula rapunculus|Rapunzelklokje|Vaatplant| +|257|S09000360|Corrigiola litoralis|Riempjes|Vaatplant| +|258|S09001330|Vaccinium uliginosum|Rijsbes|Vaatplant| +|259|S09000719|Leersia oryzoides|Rijstgras|Vaatplant| +|260|S09001158|Blysmus rufus|Rode bies|Vaatplant| +|261|S09000472|Erica cinerea|Rode dophei|Vaatplant| +|262|S09000509|Odontites vernus subsp. serotinus|Rode ogentroost|Vaatplant| +|263|S09001034|Pyrola rotundifolia|Rond wintergroen|Vaatplant| +|264|S09000221|Carex diandra|Ronde zegge|Vaatplant| +|265|S09000418|Drosera rotundifolia|Ronde zonnedauw|Vaatplant| +|266|S09000392|Daphne mezereum|Rood peperboompje|Vaatplant| +|267|S09000061|Antennaria dioica|Rozenkransje|Vaatplant| +|268|S09000645|Hypericum hirsutum|Ruig hertshooi|Vaatplant| +|269|S09000402|Dianthus armeria|Ruige anjer|Vaatplant| +|270|S09000726|Leontodon hispidus|Ruige leeuwentand|Vaatplant| +|271|S09000949|Plantago media|Ruige weegbree|Vaatplant| +|272|S09000827|Milium vernale|Ruw gierstgras|Vaatplant| +|273|S09000751|Lithospermum arvense|Ruw parelzaad|Vaatplant| +|274|S09000536|Gagea spathacea|Schedegeelster|Vaatplant| +|275|S09000293|Cerastium diffusum|Scheve hoornbloem|Vaatplant| +|276|S09001262|Taraxacum celticum|Schraallandpaardenbloem|Vaatplant| +|277|S09000076|Apium graveolens|Selderij|Vaatplant| +|278|S09001111|Sagina nodosa|Sierlijke vetmuur|Vaatplant| +|279|S09000477|Eriophorum gracile|Slank wollegras|Vaatplant| +|280|S09000562|Gentianella amarella|Slanke gentiaan|Vaatplant| +|281|S09000242|Carex limosa|Slijkzegge|Vaatplant| +|282|S09000067|Anthoxanthum aristatum|Slofhak|Vaatplant| +|283|S09001107|Ruppia maritima|Snavelruppia|Vaatplant| +|284|S09000888|Orchis militaris|Soldaatje|Vaatplant| +|285|S09000332|Cirsium dissectum|Spaanse ruiter|Vaatplant| +|286|S09000742|Kickxia elatine|Spiesleeuwenbek|Vaatplant| +|287|S09001460|Caltha palustris subsp. araneosa|Spindotterbloem|Vaatplant| +|288|S09000612|Hieracium lactucella|Spits havikskruid|Vaatplant| +|289|S09000404|Dianthus deltoides|Steenanjer|Vaatplant| +|290|S09000558|Genista anglica|Stekelbrem|Vaatplant| +|291|S09000774|Lycopodium annotinum|Stekende wolfsklauw|Vaatplant| +|292|S09001016|Primula vulgaris|Stengelloze sleutelbloem|Vaatplant| +|293|S09000276|Catapodium rigidum|Stijf hardgras|Vaatplant| +|294|S09000175|Calamagrostis stricta|Stijf struisriet|Vaatplant| +|295|S09000845|Myosotis stricta|Stijf vergeet-mij-nietje|Vaatplant| +|296|S09000429|Baldellia ranunculoides subsp. ranunculoides|Stijve moerasweegbree|Vaatplant| +|297|S09000979|Polystichum aculeatum|Stijve naaldvaren|Vaatplant| +|298|S09002316|Euphrasia stricta s.l.|Stijve ogentroost|Vaatplant| +|299|S09000488|Erysimum virgatum|Stijve steenraket|Vaatplant| +|300|S09000063|Anthemis cotula|Stinkende kamille|Vaatplant| +|301|S09000256|Carex punctata|Stippelzegge|Vaatplant| +|302|S09000834|Monotropa hypopitys|Stofzaad|Vaatplant| +|303|S09000138|Beta vulgaris subsp. maritima|Strandbiet|Vaatplant| +|304|S09000053|Anagallis tenella|Teer guichelheil|Vaatplant| +|305|S09000850|Myriophyllum alterniflorum|Teer vederkruid|Vaatplant| +|306|S09000829|Minuartia hybrida|Tengere veldmuur|Vaatplant| +|307|S09001315|Arabis glabra|Torenkruid|Vaatplant| +|308|S09001180|Sedum rupestre|Tripmadam|Vaatplant| +|309|S09001610|Bromus racemosus|Trosdravik|Vaatplant| +|310|S09000223|Carex dioica|Tweehuizige zegge|Vaatplant| +|311|S09000093|Arnica montana|Valkruid|Vaatplant| +|312|S09000062|Anthemis arvensis|Valse kamille|Vaatplant| +|313|S09001149|Scheuchzeria palustris|Veenbloembies|Vaatplant| +|314|S09000597|Hammarbya paludosa|Veenmosorchis|Vaatplant| +|315|S09000626|Hierochloe odorata|Veenreukgras|Vaatplant| +|316|S09000563|Gentianella campestris|Veldgentiaan|Vaatplant| +|317|S09000637|Hordeum secalinum|Veldgerst|Vaatplant| +|318|S09001128|Salvia pratensis|Veldsalie|Vaatplant| +|319|S09000561|Genista tinctoria|Verfbrem|Vaatplant| +|320|S09000467|Equisetum ramosissimum|Vertakte paardenstaart|Vaatplant| +|321|S09000942|Pinguicula vulgaris|Vetblad|Vaatplant| +|322|S09000222|Carex digitata|Vingerzegge|Vaatplant| +|323|S09000884|Dactylorhiza incarnata|Vleeskleurige orchis|Vaatplant| +|324|S09000881|Ophrys insectifera|Vliegenorchis|Vaatplant| +|325|S09001154|Eleogiton fluitans|Vlottende bies|Vaatplant| +|326|S09000255|Carex pulicaris|Vlozegge|Vaatplant| +|327|S09000861|Neottia nidus-avis|Vogelnestje|Vaatplant| +|328|S09001304|Trifolium ornithopodioides|Vogelpootklaver|Vaatplant| +|329|S09001013|Potentilla tabernaemontani|Voorjaarsganzerik|Vaatplant| +|330|S09000218|Carex caryophyllea|Voorjaarszegge|Vaatplant| +|331|S09000268|Carex vulpina|Voszegge|Vaatplant| +|332|S09000346|Comarum palustre|Wateraardbei|Vaatplant| +|333|S09000821|Menyanthes trifoliata|Waterdrieblad|Vaatplant| +|334|S09001183|Jacobaea aquatica|Waterkruiskruid|Vaatplant| +|335|S09000764|Ludwigia palustris|Waterlepeltje|Vaatplant| +|336|S09000754|Lobelia dortmanna|Waterlobelia|Vaatplant| +|337|S09001200|Silaum silaus|Weidekervel|Vaatplant| +|338|S09000014|Agrimonia procera|Welriekende agrimonie|Vaatplant| +|339|S09000950|Platanthera bifolia|Welriekende nachtorchis|Vaatplant| +|340|S09000689|Juncus tenageia|Wijdbloeiende rus|Vaatplant| +|341|S09000862|Nepeta cataria|Wild kattenkruid|Vaatplant| +|342|S09000849|Myrica gale|Wilde gagel|Vaatplant| +|343|S09000532|Fritillaria meleagris|Wilde kievitsbloem|Vaatplant| +|344|S09000818|Mentha suaveolens|Witte munt|Vaatplant| +|345|S09000936|Phyteuma spicatum subsp. spicatum|Witte rapunzel|Vaatplant| +|346|S09001068|Rhynchospora alba|Witte snavelbies|Vaatplant| +|347|S09001053|Ranunculus ololeucos|Witte waterranonkel|Vaatplant| +|348|S09000071|Anthyllis vulneraria|Wondklaver|Vaatplant| +|349|S09001193|Serratula tinctoria|Zaagblad|Vaatplant| +|350|S09001181|Sedum sexangulare|Zacht vetkruid|Vaatplant| +|351|S09000500|Euphorbia seguieriana|Zandwolfsmelk|Vaatplant| +|352|S09000100|Seriphidium maritimum|Zeealsem|Vaatplant| +|353|S09000635|Hordeum marinum|Zeegerst|Vaatplant| +|354|S09001110|Sagina maritima|Zeevetmuur|Vaatplant| +|355|S09000948|Plantago maritima|Zeeweegbree|Vaatplant| +|356|S09000497|Euphorbia paralias|Zeewolfsmelk|Vaatplant| +|357|S09000870|Oenanthe lachenalii|Zilt torkruid|Vaatplant| +|358|S09001379|Viola lutea subsp. calaminaria|Zinkviooltje|Vaatplant| +|359|S09000734|Leucojum aestivum|Zomerklokje|Vaatplant| +|360|S09000935|Phyteuma spicatum subsp. nigrum|Zwartblauwe rapunzel|Vaatplant| +|361|S09000356|Cornus suecica|Zweedse kornoelje|Vaatplant| +|362|S02017170|Coccothraustes coccothraustes|Appelvink|Broedvogel| +|363|S02013640|Panurus biarmicus|Baardman|Broedvogel| +|364|S02001730|Tadorna tadorna|Bergeend|Broedvogel| +|365|S02011060|Luscinia svecica|Blauwborst|Broedvogel| +|366|S02002610|Circus cyaneus|Blauwe kiekendief|Broedvogel| +|367|S02004700|Charadrius hiaticula|Bontbekplevier|Broedvogel| +|368|S02013490|Ficedula hypoleuca ssp. hypoleuca|Bonte vliegenvanger|Broedvogel| +|369|S02014790|Sitta europaea|Boomklever|Broedvogel| +|370|S02014870|Certhia brachydactyla|Boomkruiper|Broedvogel| +|371|S02009740|Lullula arborea|Boomleeuwerik|Broedvogel| +|372|S02010090|Anthus trivialis|Boompieper|Broedvogel| +|373|S02012740|Sylvia curruca|Braamsluiper|Broedvogel| +|374|S02002600|Circus aeruginosus|Bruine kiekendief|Broedvogel| +|375|S02014900|Remiz pendulinus|Buidelmees|Broedvogel| +|376|S02002870|Buteo buteo ssp. buteo|Buizerd|Broedvogel| +|377|S02012200|Cettia cetti|Cetti's zanger|Broedvogel| +|378|S02000070|Tachybaptus ruficollis|Dodaars|Broedvogel| +|379|S02008480|Jynx torquilla|Draaihals|Broedvogel| +|380|S02010050|Anthus campestris|Duinpieper|Broedvogel| +|381|S02006240|Sterna albifrons|Dwergstern|Broedvogel| +|382|S02002060|Somateria mollissima|Eider|Broedvogel| +|383|S02013080|Phylloscopus sibilatrix|Fluiter|Broedvogel| +|384|S02018570|Emberiza citrinella|Geelgors|Broedvogel| +|385|S02011220|Phoenicurus phoenicurus|Gekraagde roodstaart|Broedvogel| +|386|S02010171|Motacilla flava|Gele kwikstaart|Broedvogel| +|387|S02000120|Podiceps nigricollis|Geoorde fuut|Broedvogel| +|388|S02014400|Parus palustris ssp. palustris|Glanskop|Broedvogel| +|389|S02010110|Anthus pratensis|Graspieper|Broedvogel| +|390|S02018820|Emberiza calandra|Grauwe gors|Broedvogel| +|391|S02002630|Circus pygargus|Grauwe kiekendief|Broedvogel| +|392|S02015150|Lanius collurio|Grauwe klauwier|Broedvogel| +|393|S02013350|Muscicapa striata|Grauwe vliegenvanger|Broedvogel| +|394|S02004590|Burhinus oedicnemus ssp. oedicnemus|Griel|Broedvogel| +|395|S02008560|Picus viridis|Groene specht|Broedvogel| +|396|S02016490|Chloris chloris|Groenling|Broedvogel| +|397|S02008760|Dendrocopos major|Grote bonte specht|Broedvogel| +|398|S02010190|Motacilla cinerea ssp. cinerea|Grote gele kwikstaart|Broedvogel| +|399|S02012530|Acrocephalus arundinaceus|Grote karekiet|Broedvogel| +|400|S02006110|Sterna sandvicensis|Grote stern|Broedvogel| +|401|S02001210|Casmerodius albus|Grote zilverreiger|Broedvogel| +|402|S02005320|Limosa limosa|Grutto|Broedvogel| +|403|S02002670|Accipiter gentilis ssp. gentilis|Havik|Broedvogel| +|404|S02008310|Alcedo atthis ssp. ispida|IJsvogel|Broedvogel| +|405|S02016380|Fringilla montifringilla|Keep|Broedvogel| +|406|S02005170|Philomachus pugnax|Kemphaan|Broedvogel| +|407|S02015200|Lanius excubitor|Klapekster|Broedvogel| +|408|S02004100|Porzana parva|Klein waterhoen|Broedvogel| +|409|S02016634|Carduelis cabaret|Kleine barmsijs|Broedvogel| +|410|S02008870|Dendrocopos minor|Kleine bonte specht|Broedvogel| +|411|S02004690|Charadrius dubius|Kleine plevier|Broedvogel| +|412|S02004110|Porzana pusilla|Kleinst waterhoen|Broedvogel| +|413|S02004560|Recurvirostra avosetta|Kluut|Broedvogel| +|414|S02016600|Carduelis cannabina|Kneu|Broedvogel| +|415|S02003320|Tetrao tetrix|Korhoen|Broedvogel| +|416|S02004330|Grus grus|Kraanvogel|Broedvogel| +|417|S02001820|Anas strepera|Krakeend|Broedvogel| +|418|S02001960|Netta rufina|Krooneend|Broedvogel| +|419|S02002030|Aythya fuligula|Kuifeend|Broedvogel| +|420|S02001040|Nycticorax nycticorax|Kwak|Broedvogel| +|421|S02003700|Coturnix coturnix|Kwartel|Broedvogel| +|422|S02004210|Crex crex|Kwartelkoning|Broedvogel| +|423|S02001440|Platalea leucorodia|Lepelaar|Broedvogel| +|424|S02014420|Parus montanus|Matkop|Broedvogel| +|425|S02008830|Dendrocopos medius|Middelste bonte specht|Broedvogel| +|426|S02017100|Pyrrhula pyrrhula ssp. europoea|Midden-Europese goudvink|Broedvogel| +|427|S02011040|Luscinia megarhynchos|Nachtegaal|Broedvogel| +|428|S02007780|Caprimulgus europaeus ssp. europaeus|Nachtzwaluw|Broedvogel| +|429|S02006160|Sterna paradisaea|Noordse stern|Broedvogel| +|430|S02009810|Riparia riparia ssp. riparia|Oeverzwaluw|Broedvogel| +|431|S02001340|Ciconia ciconia ssp. ciconia|Ooievaar|Broedvogel| +|432|S02018660|Emberiza hortulana|Ortolaan|Broedvogel| +|433|S02011370|Saxicola rubetra|Paapje|Broedvogel| +|434|S02003670|Perdix perdix|Patrijs|Broedvogel| +|435|S02001890|Anas acuta ssp. acuta|Pijlstaart|Broedvogel| +|436|S02004080|Porzana porzana|Porseleinhoen|Broedvogel| +|437|S02001240|Ardea purpurea|Purperreiger|Broedvogel| +|438|S02016530|Carduelis carduelis|Putter|Broedvogel| +|439|S02015720|Corvus corax|Raaf|Broedvogel| +|440|S02012430|Acrocephalus schoenobaenus|Rietzanger|Broedvogel| +|441|S02000950|Botaurus stellaris|Roerdomp|Broedvogel| +|442|S02011390|Saxicola rubicola|Roodborsttapuit|Broedvogel| +|443|S02004500|Haematopus ostralegus|Scholekster|Broedvogel| +|444|S02016540|Carduelis spinus|Sijs|Broedvogel| +|445|S02001940|Anas clypeata|Slobeend|Broedvogel| +|446|S02012380|Locustella luscinioides|Snor|Broedvogel| +|447|S02012590|Hippolais icterina|Spotvogel|Broedvogel| +|448|S02012360|Locustella naevia|Sprinkhaanzanger|Broedvogel| +|449|S02004770|Charadrius alexandrinus|Strandplevier|Broedvogel| +|450|S02011460|Oenanthe oenanthe|Tapuit|Broedvogel| +|451|S02003040|Falco tinnunculus ssp. tinnunculus|Torenvalk|Broedvogel| +|452|S02005460|Tringa totanus|Tureluur|Broedvogel| +|453|S02009760|Alauda arvensis|Veldleeuwerik|Broedvogel| +|454|S02007680|Asio flammeus|Velduil|Broedvogel| +|455|S02006150|Sterna hirundo|Visdief|Broedvogel| +|456|S02013150|Regulus ignicapilla|Vuurgoudhaan|Broedvogel| +|457|S02004070|Rallus aquaticus|Waterral|Broedvogel| +|458|S02005190|Gallinago gallinago|Watersnip|Broedvogel| +|459|S02002310|Pernis apivorus|Wespendief|Broedvogel| +|460|S02015080|Oriolus oriolus|Wielewaal|Broedvogel| +|461|S02001840|Anas crecca|Wintertaling|Broedvogel| +|462|S02000980|Ixobrychus minutus|Woudaap|Broedvogel| +|463|S02005410|Numenius arquata|Wulp|Broedvogel| +|464|S02012000|Turdus philomelos|Zanglijster|Broedvogel| +|465|S02001910|Anas querquedula|Zomertaling|Broedvogel| +|466|S02008630|Dryocopus martius|Zwarte specht|Broedvogel| +|467|S02006270|Chlidonias niger ssp. niger|Zwarte stern|Broedvogel| +|468|S02005750|Larus melanocephalus|Zwartkopmeeuw|Broedvogel| + + + \ No newline at end of file diff --git a/sample/dk_plant.py b/sample/dk_plant.py index da37c8ad23256d81cee0bc69719666be658934fc..23865d56028fcacd84838f7776fb2524cf1eeb8c 100644 --- a/sample/dk_plant.py +++ b/sample/dk_plant.py @@ -89,7 +89,7 @@ for row in dk.itertuples(): else: mean_freq = sel.Frequentie.mean() mean_trouw = sel.Trouw.mean() - dk_ww = hlp.draagkracht_ww(frequentie=mean_freq, trouw=mean_trouw) + dk_ww = hlp.draagkracht_ww(frequentie=mean_freq, trouw=mean_trouw, th=0.01) print('{0} X {1}: n={2} freq={3} trouw={4} dk={5}' .format(row.Scientific_name, row.Land_type_code, sel.shape[0], mean_freq, mean_trouw, dk_ww)) @@ -98,16 +98,25 @@ for row in dk.itertuples(): dk.loc[row.Index, 'Land_type_quality'] = dk_ww '''Write draagkracht file per species''' -# TODO: minimale draagkracht is 0.01 -# TODO: - +fails = [] for species_code in list(set(dk.Species_code)): local_name = code2localname[species_code].replace(' ', '_') - sel = dk.loc[(dk.Species_code == species_code) & (dk.Land_type_quality.notna() & dk.Land_type_quality >= 0.01), + sel = dk.loc[(dk.Species_code == species_code) & (dk.Land_type_quality.notna()), ['Species_code', 'Land_type_code', 'Land_type_quality']].round({'Land_type_quality': 3}) if not sel.empty: sel.to_csv(r'c:\apps\z_temp\mnp_dk\03_MNP_versie7_par_density_factors_{}.csv'.format(local_name), - index=False, header=True, sep=',') + index=False, header=True, sep=',') + print('To file: {}'.format(local_name)) + else: + sel = pd.Series({'Species_code': species_code, 'Local_name': local_name, + 'Scientific_name': code2scientificname[species_code], 'msg': 'failed'}) + fails.append(sel) + print('Fail: {}'.format(local_name)) +if len(fails) > 0: + fails_df = pd.concat(fails, axis=1) + fails_df.T.to_csv(r'c:\apps\z_temp\mnp_dk\03_MNP_versie7_par_density_factors_MISSING.csv', + index=True, header=True, sep='\t') + '''5. Reporting diff --git a/sample/dk_vogel_vlinder.py b/sample/dk_vogel_vlinder.py index db2da3743e0d473f605d58628c1dd714a77e7edb..0f0042da6d43d48dc9abca5074df875869ca25e9 100644 --- a/sample/dk_vogel_vlinder.py +++ b/sample/dk_vogel_vlinder.py @@ -54,7 +54,7 @@ for i, species in enumerate(species, start=1): sp = hlp.Species(species) ndff = hlp.query_ndff(gdf=ndff_all, species=sp, max_area=10000) # NDFF shapefile for selected species. except (AssertionError, ImportError) as e: - hlp.write2file(df=pd.Series({sp.naam_ned: e}), out_name='error_{}'.format(species), out_dir=args.out_dir) + hlp.write2file(df=pd.Series({species: e}), out_name='error_{}'.format(species), out_dir=args.out_dir) continue out_name = '03_MNP_versie7_par_density_factors_{0}'.format(sp.naam_ned) @@ -131,12 +131,17 @@ for i, species in enumerate(species, start=1): draagkracht = areas.loc[:, '{}_ndffpxls'.format(beheertype)].divide(areas.loc[:, beheertype]).max().round(3) if draagkracht >= args.th: dks[beheertype] = {'Species_code': sp.mnp_species_code, 'Land_type_code': beheertype, - 'Land_type_quality': draagkracht} + 'Land_type_quality': draagkracht} else: continue except KeyError: continue + out = pd.DataFrame.from_dict(dks, orient='index') - hlp.write2file(df=out, out_name=out_name, out_dir=args.out_dir) + if not out.empty: + print(' {0} matched to {1} beheertypen'.format(sp.naam_ned, out.shape[0])) + hlp.write2file(df=out, out_name=out_name, out_dir=args.out_dir) + else: + print(' zero dk for {}'.format(sp.naam_ned)) diff --git a/sample/mnp/helpers.py b/sample/mnp/helpers.py index 165753094ed7639e967b10d79ab2e2eb792c1601..ae6c073ed18d0ae9da960921f55498482252ed9e 100644 --- a/sample/mnp/helpers.py +++ b/sample/mnp/helpers.py @@ -450,6 +450,7 @@ def ndff_sources(): 'dagvlinder': r'W:\PROJECTS\MNP2020\c_fases\f7_draagkracht\a_source_data\vlinders_ndff_shapefiles\ndff_vlinders_merged_okt2020.shp', 'test': r'c:\apps\temp_geodata\ndff\ndff_vogel_sample.shp'} + class Species: """ Class holding all info related to a species @@ -594,15 +595,19 @@ def fix_bt(code_in, as_mnp=False): return '{0}{1}.{2}'.format(pre, head, tail) -def draagkracht_ww(frequentie, trouw): +def draagkracht_ww(frequentie, trouw, th): """ Draagkracht formule volgens Wieger Wamelink. Zie MS Teams discussie 16-07-2020 MNP2020/Fase 7 Objectivering Draagk.. :param frequentie: gemiddelde frequentie van soort X binnen beheertype Y :param trouw: gemiddelde trouw van soort X binnen beheertype Y + :param th: minumum draagkracht value :return: draagkracht soort X - beheertype Y combinatie, gemaximaliseerd tot 1. """ dk = np.min([np.multiply(np.divide(np.max([frequentie, trouw]), 100), 5), 1]) - return dk + if dk >= th: + return dk + else: + return np.nan def valid_dir(x):