Commit 914d5f70 authored by Roelofsen, Hans's avatar Roelofsen, Hans
Browse files

update to species table and methods for using it

parent a81c36c8
import numbers
def fix_bt(code_in, as_mnp=False, verbose=False):
def fix_bt(code_in, as_mnp=False, verbose=False, strict=True):
"""
Parser for Beheertype codes to repair abbreviated codes and/or MNP extension
eg. 02.01 --> N02.01 if as_mnp==False
......@@ -18,6 +18,8 @@ def fix_bt(code_in, as_mnp=False, verbose=False):
N04.02.00 is equivalent to N04.02
:param code_in: beheertypecode in any format
:param as_mnp: return MNP style beheertypecode, default=False
:param verbose: verbose feedback
:param strict: raise error if bt code is unexpected
:return: beheertypecode
"""
......@@ -30,14 +32,20 @@ def fix_bt(code_in, as_mnp=False, verbose=False):
# Identify parts of code
parts = code_in.split(".")
if len(parts) == 1:
raise AssertionError("1. Unexpected BT code: {}".format(code_in))
if strict:
raise AssertionError("1. Unexpected BT code: {}".format(code_in))
else:
return None
elif len(parts) == 2:
top, sub = parts
neer = None
elif len(parts) == 3:
top, sub, neer = parts
else:
raise AssertionError("2. Unexpected BT code: {}".format(code_in))
if strict:
raise AssertionError("2. Unexpected BT code: {}".format(code_in))
else:
return None
# Verify TOP and add "N" is required
assert top[0].upper() in ['N', 'W', 'S', 'T', 'A', 'L'], "3. Unexpected BT Code: {}".format(code_in)
......
"""
Module to read MNP species CSV tab and provide several helper dictionaries
"""
import pandas as pd
import os
import pathlib
filepath = pathlib.Path(__file__)
# De volledige Species tabel als Pandas dataframe
species_tab = pd.read_csv(os.path.join(os.path.dirname(filepath), r'resources\mnp_species.csv'), sep=',', comment='#')
# Dictionaries tussen code, lokale naam, wetenschappelijke naam
code2local = dict(zip(species_tab.Species_code, species_tab.Local_name))
local2code = dict(zip(species_tab.Local_name, species_tab.Species_code))
code2scientific = dict(zip(species_tab.Species_code, species_tab.Scientific_name))
scientific2code = dict(zip(species_tab.Scientific_name, species_tab.Species_code))
local2scientific = dict(zip(species_tab.Local_name, species_tab.Scientific_name))
scientific2local = dict(zip(species_tab.Scientific_name, species_tab.Local_name))
code2taxon = dict(zip(species_tab.Species_code, species_tab.taxon))
# Dictionaries to self, is usefull sometimes. Trust me...
local2local = dict(zip(species_tab.Local_name, species_tab.Local_name))
code2code = dict(zip(species_tab.Species_code, species_tab.Species_code))
scientific2scientific = dict(zip(species_tab.Scientific_name, species_tab.Scientific_name))
# Dict between species code and boolean species list
code2sel468 = dict(zip(species_tab.Species_code, species_tab.sel468.map({1: True, 0: False})))
code2sel281 = dict(zip(species_tab.Species_code, species_tab.sel281.map({1: True, 0: False})))
code2sel146 = dict(zip(species_tab.Species_code, species_tab.sel146.map({1: True, 0: False})))
code2selall = dict(zip(species_tab.Species_code, species_tab.selall.map({1: True, 0: False})))
# MNP Species tabel. Gebaseerd op w:\PROJECTS\qmar\MNP-SNL-ParameterSet\Parameters_v06_2019_12_09\08_MNP_versie4_par_taxonomic_group.csv en w:\PROJECTS\qmar\MNP-SNL-ParameterSet\Parameters_v06_2019_12_09\09_MNP_versie4_Group_Species_valid model_468.csv
# Door: Hans Roelofsen, 18-May-2021 10:36
Species_code,Scientific_name,Local_name,tax_group
S02000070,Tachybaptus ruficollis,Dodaars,Vertebraten
S02000120,Podiceps nigricollis,Geoorde fuut,Vertebraten
S02000950,Botaurus stellaris,Roerdomp,Vertebraten
S02000980,Ixobrychus minutus,Woudaap,Vertebraten
S02001040,Nycticorax nycticorax,Kwak,Vertebraten
S02001210,Casmerodius albus,Grote zilverreiger,Vertebraten
S02001240,Ardea purpurea,Purperreiger,Vertebraten
S02001340,Ciconia ciconia ssp. ciconia,Ooievaar,Vertebraten
S02001440,Platalea leucorodia,Lepelaar,Vertebraten
S02001730,Tadorna tadorna,Bergeend,Vertebraten
S02001820,Anas strepera,Krakeend,Vertebraten
S02001840,Anas crecca,Wintertaling,Vertebraten
S02001890,Anas acuta ssp. acuta,Pijlstaart,Vertebraten
S02001910,Anas querquedula,Zomertaling,Vertebraten
S02001940,Anas clypeata,Slobeend,Vertebraten
S02001960,Netta rufina,Krooneend,Vertebraten
S02002030,Aythya fuligula,Kuifeend,Vertebraten
S02002060,Somateria mollissima,Eider,Vertebraten
S02002310,Pernis apivorus,Wespendief,Vertebraten
S02002600,Circus aeruginosus,Bruine kiekendief,Vertebraten
S02002610,Circus cyaneus,Blauwe kiekendief,Vertebraten
S02002630,Circus pygargus,Grauwe kiekendief,Vertebraten
S02002670,Accipiter gentilis ssp. gentilis,Havik,Vertebraten
S02002870,Buteo buteo ssp. buteo,Buizerd,Vertebraten
S02003040,Falco tinnunculus ssp. tinnunculus,Torenvalk,Vertebraten
S02003320,Tetrao tetrix,Korhoen,Vertebraten
S02003670,Perdix perdix,Patrijs,Vertebraten
S02003700,Coturnix coturnix,Kwartel,Vertebraten
S02004070,Rallus aquaticus,Waterral,Vertebraten
S02004080,Porzana porzana,Porseleinhoen,Vertebraten
S02004100,Porzana parva,Klein waterhoen,Vertebraten
S02004110,Porzana pusilla,Kleinst waterhoen,Vertebraten
S02004210,Crex crex,Kwartelkoning,Vertebraten
S02004330,Grus grus,Kraanvogel,Vertebraten
S02004500,Haematopus ostralegus,Scholekster,Vertebraten
S02004560,Recurvirostra avosetta,Kluut,Vertebraten
S02004590,Burhinus oedicnemus ssp. oedicnemus,Griel,Vertebraten
S02004690,Charadrius dubius,Kleine plevier,Vertebraten
S02004700,Charadrius hiaticula,Bontbekplevier,Vertebraten
S02004770,Charadrius alexandrinus,Strandplevier,Vertebraten
S02005170,Philomachus pugnax,Kemphaan,Vertebraten
S02005190,Gallinago gallinago,Watersnip,Vertebraten
S02005320,Limosa limosa,Grutto,Vertebraten
S02005410,Numenius arquata,Wulp,Vertebraten
S02005460,Tringa totanus,Tureluur,Vertebraten
S02005750,Larus melanocephalus,Zwartkopmeeuw,Vertebraten
S02006110,Sterna sandvicensis,Grote stern,Vertebraten
S02006150,Sterna hirundo,Visdief,Vertebraten
S02006160,Sterna paradisaea,Noordse stern,Vertebraten
S02006240,Sterna albifrons,Dwergstern,Vertebraten
S02006270,Chlidonias niger ssp. niger,Zwarte stern,Vertebraten
S02007680,Asio flammeus,Velduil,Vertebraten
S02007780,Caprimulgus europaeus ssp. europaeus,Nachtzwaluw,Vertebraten
S02008310,Alcedo atthis ssp. ispida,IJsvogel,Vertebraten
S02008480,Jynx torquilla,Draaihals,Vertebraten
S02008560,Picus viridis,Groene specht,Vertebraten
S02008630,Dryocopus martius,Zwarte specht,Vertebraten
S02008760,Dendrocopos major,Grote bonte specht,Vertebraten
S02008830,Dendrocopos medius,Middelste bonte specht,Vertebraten
S02008870,Dendrocopos minor,Kleine bonte specht,Vertebraten
S02009740,Lullula arborea,Boomleeuwerik,Vertebraten
S02009760,Alauda arvensis,Veldleeuwerik,Vertebraten
S02009810,Riparia riparia ssp. riparia,Oeverzwaluw,Vertebraten
S02010050,Anthus campestris,Duinpieper,Vertebraten
S02010090,Anthus trivialis,Boompieper,Vertebraten
S02010110,Anthus pratensis,Graspieper,Vertebraten
S02010171,Motacilla flava,Gele kwikstaart,Vertebraten
S02010190,Motacilla cinerea ssp. cinerea,Grote gele kwikstaart,Vertebraten
S02011040,Luscinia megarhynchos,Nachtegaal,Vertebraten
S02011060,Luscinia svecica,Blauwborst,Vertebraten
S02011220,Phoenicurus phoenicurus,Gekraagde roodstaart,Vertebraten
S02011370,Saxicola rubetra,Paapje,Vertebraten
S02011390,Saxicola rubicola,Roodborsttapuit,Vertebraten
S02011460,Oenanthe oenanthe,Tapuit,Vertebraten
S02012000,Turdus philomelos,Zanglijster,Vertebraten
S02012200,Cettia cetti,Cetti's zanger,Vertebraten
S02012360,Locustella naevia,Sprinkhaanzanger,Vertebraten
S02012380,Locustella luscinioides,Snor,Vertebraten
S02012430,Acrocephalus schoenobaenus,Rietzanger,Vertebraten
S02012530,Acrocephalus arundinaceus,Grote karekiet,Vertebraten
S02012590,Hippolais icterina,Spotvogel,Vertebraten
S02012740,Sylvia curruca,Braamsluiper,Vertebraten
S02013080,Phylloscopus sibilatrix,Fluiter,Vertebraten
S02013150,Regulus ignicapilla,Vuurgoudhaan,Vertebraten
S02013350,Muscicapa striata,Grauwe vliegenvanger,Vertebraten
S02013490,Ficedula hypoleuca ssp. hypoleuca,Bonte vliegenvanger,Vertebraten
S02013640,Panurus biarmicus,Baardman,Vertebraten
S02014400,Parus palustris ssp. palustris,Glanskop,Vertebraten
S02014420,Parus montanus,Matkop,Vertebraten
S02014790,Sitta europaea,Boomklever,Vertebraten
S02014870,Certhia brachydactyla,Boomkruiper,Vertebraten
S02014900,Remiz pendulinus,Buidelmees,Vertebraten
S02015080,Oriolus oriolus,Wielewaal,Vertebraten
S02015150,Lanius collurio,Grauwe klauwier,Vertebraten
S02015200,Lanius excubitor,Klapekster,Vertebraten
S02015720,Corvus corax,Raaf,Vertebraten
S02016380,Fringilla montifringilla,Keep,Vertebraten
S02016490,Chloris chloris,Groenling,Vertebraten
S02016530,Carduelis carduelis,Putter,Vertebraten
S02016540,Carduelis spinus,Sijs,Vertebraten
S02016600,Carduelis cannabina,Kneu,Vertebraten
S02016634,Carduelis cabaret,Kleine barmsijs,Vertebraten
S02017100,Pyrrhula pyrrhula ssp. europoea,Midden-Europese goudvink,Vertebraten
S02017170,Coccothraustes coccothraustes,Appelvink,Vertebraten
S02018570,Emberiza citrinella,Geelgors,Vertebraten
S02018660,Emberiza hortulana,Ortolaan,Vertebraten
S02018820,Emberiza calandra,Grauwe gors,Vertebraten
S06000002,Carterocephalus palaemon,Bont dikkopje,Evertebraten
S06000003,Thymelicus sylvestris,Geelsprietdikkopje,Evertebraten
S06000004,Thymelicus lineola,Zwartsprietdikkopje,Evertebraten
S06000006,Hesperia comma,Kommavlinder,Evertebraten
S06000007,Ochlodes faunus,Groot dikkopje,Evertebraten
S06000008,Erynnis tages,Bruin dikkopje,Evertebraten
S06000012,Pyrgus malvae,Aardbeivlinder,Evertebraten
S06000019,Anthocharis cardamines,Koninginnenpage,Evertebraten
S06000035,Callophrys rubi,Groentje,Evertebraten
S06000042,Lycaena dispar,Grote vuurvlinder,Evertebraten
S06000044,Lycaena tityrus,Bruine vuurvlinder,Evertebraten
S06000049,Plebeius argus,Heideblauwtje,Evertebraten
S06000050,Plebeius idas ssp. idas,Vals heideblauwtje,Evertebraten
S06000051,Plebeius optilete,Veenbesblauwtje,Evertebraten
S06000052,Aricia agestis,Bruin blauwtje,Evertebraten
S06000057,Maculinea alcon,Gentiaanblauwtje,Evertebraten
S06000061,Maculinea teleius,Pimpernelblauwtje,Evertebraten
S06000062,Maculinea nausithous,Donker pimpernelblauwtje,Evertebraten
S06000064,Limenitis camilla,Kleine ijsvogelvlinder,Evertebraten
S06000065,Limenitis populi,Grote ijsvogelvlinder,Evertebraten
S06000066,Apatura iris,Grote weerschijnvlinder,Evertebraten
S06000076,Boloria aquilonaris,Veenbesparelmoervlinder,Evertebraten
S06000077,Boloria selene,Zilveren maan,Evertebraten
S06000080,Brenthis ino,Purperstreepparelmoervlinder,Evertebraten
S06000081,Issoria lathonia,Kleine parelmoervlinder,Evertebraten
S06000082,Argynnis niobe,Duinparelmoervlinder,Evertebraten
S06000084,Argynnis aglaja,Grote parelmoervlinder,Evertebraten
S06000088,Melitaea cinxia,Veldparelmoervlinder,Evertebraten
S06000092,Lasiommata megera,Argusvlinder,Evertebraten
S06000097,Coenonympha arcania,Tweekleurig hooibeestje,Evertebraten
S06000098,Coenonympha pamphilus,Hooibeestje,Evertebraten
S06000099,Coenonympha tullia ssp. tullia,Veenhooibeestje,Evertebraten
S06000101,Maniola jurtina,Bruin zandoogje,Evertebraten
S06000106,Hipparchia semele,Heivlinder,Evertebraten
S06000107,Hipparchia statilinus,Kleine heivlinder,Evertebraten
S09000008,Actaea spicata,Christoffelkruid,Planten
S09000013,Agrimonia eupatoria,Gewone agrimonie,Planten
S09000014,Agrimonia procera,Welriekende agrimonie,Planten
S09000015,Agrostemma githago,Bolderik,Planten
S09000031,Allium oleraceum,Moeslook,Planten
S09000034,Allium ursinum,Daslook,Planten
S09000039,Alopecurus bulbosus,Knolvossenstaart,Planten
S09000043,Althaea officinalis,Heemst,Planten
S09000044,Alyssum alyssoides,Bleek schildzaad,Planten
S09000051,Anacamptis pyramidalis,Hondskruid,Planten
S09000053,Anagallis tenella,Teer guichelheil,Planten
S09000055,Andromeda polifolia,Lavendelhei,Planten
S09000061,Antennaria dioica,Rozenkransje,Planten
S09000062,Anthemis arvensis,Valse kamille,Planten
S09000063,Anthemis cotula,Stinkende kamille,Planten
S09000067,Anthoxanthum aristatum,Slofhak,Planten
S09000071,Anthyllis vulneraria,Wondklaver,Planten
S09000072,Misopates orontium,Akkerleeuwenbek,Planten
S09000074,Aphanes arvensis,Grote leeuwenklauw,Planten
S09000076,Apium graveolens,Selderij,Planten
S09000077,Apium inundatum,Ondergedoken moerasscherm,Planten
S09000091,Armeria maritima,Engels gras,Planten
S09000092,Armoracia rusticana,Mierik,Planten
S09000093,Arnica montana,Valkruid,Planten
S09000094,Arnoseris minima,Korensla,Planten
S09000100,Seriphidium maritimum,Zeealsem,Planten
S09000105,Asparagus officinalis subsp. prostratus,Liggende asperge,Planten
S09000124,Atriplex laciniata,Gelobde melde,Planten
S09000138,Beta vulgaris subsp. maritima,Strandbiet,Planten
S09000146,Blechnum spicant,Dubbelloof,Planten
S09000148,Botrychium lunaria,Gelobde maanvaren,Planten
S09000153,Briza media,Bevertjes,Planten
S09000157,Bromopsis erecta,Bergdravik,Planten
S09000164,Bromus secalinus,Dreps,Planten
S09000169,Bunium bulbocastanum,Aardkastanje,Planten
S09000170,Bupleurum tenuissimum,Fijn goudscherm,Planten
S09000175,Calamagrostis stricta,Stijf struisriet,Planten
S09000191,Campanula glomerata,Kluwenklokje,Planten
S09000196,Campanula rapunculus,Rapunzelklokje,Planten
S09000213,Carex appropinquata,Paardenhaarzegge,Planten
S09000214,Carex aquatilis,Noordse zegge,Planten
S09000217,Carex buxbaumii,Knotszegge,Planten
S09000218,Carex caryophyllea,Voorjaarszegge,Planten
S09000221,Carex diandra,Ronde zegge,Planten
S09000222,Carex digitata,Vingerzegge,Planten
S09000223,Carex dioica,Tweehuizige zegge,Planten
S09000230,Carex ericetorum,Heidezegge,Planten
S09000231,Carex extensa,Kwelderzegge,Planten
S09000233,Carex flava,Gele zegge,Planten
S09000234,Carex hartmanii,Kleine knotszegge,Planten
S09000236,Carex hostiana,Blonde zegge,Planten
S09000239,Carex lasiocarpa,Draadzegge,Planten
S09000242,Carex limosa,Slijkzegge,Planten
S09000247,Carex pallescens,Bleke zegge,Planten
S09000255,Carex pulicaris,Vlozegge,Planten
S09000256,Carex punctata,Stippelzegge,Planten
S09000266,Carex trinervis,Drienervige zegge,Planten
S09000268,Carex vulpina,Voszegge,Planten
S09000269,Carlina vulgaris,Driedistel,Planten
S09000271,Carum carvi,Karwij,Planten
S09000275,Catapodium marinum,Laksteeltje,Planten
S09000276,Catapodium rigidum,Stijf hardgras,Planten
S09000279,Centaurea cyanus,Korenbloem,Planten
S09000284,Centaurea scabiosa,Grote centaurie,Planten
S09000288,Centunculus minimus,Dwergbloem,Planten
S09000289,Cephalanthera damasonium,Bleek bosvogeltje,Planten
S09000293,Cerastium diffusum,Scheve hoornbloem,Planten
S09000321,Glebionis segetum,Gele ganzenbloem,Planten
S09000323,Chrysosplenium oppositifolium,Paarbladig goudveil,Planten
S09000324,Cicendia filiformis,Draadgentiaan,Planten
S09000327,Circaea alpina,Alpenheksenkruid,Planten
S09000330,Cirsium acaule,Aarddistel,Planten
S09000332,Cirsium dissectum,Spaanse ruiter,Planten
S09000337,Cladium mariscus,Galigaan,Planten
S09000341,Cochlearia officinalis subsp. anglica,Engels lepelblad,Planten
S09000343,Cochlearia officinalis subsp. officinalis,Echt lepelblad,Planten
S09000345,Colchicum autumnale,Herfsttijloos,Planten
S09000346,Comarum palustre,Wateraardbei,Planten
S09000356,Cornus suecica,Zweedse kornoelje,Planten
S09000360,Corrigiola litoralis,Riempjes,Planten
S09000373,Crepis paludosa,Moerasstreepzaad,Planten
S09000377,Cucubalus baccifer,Besanjelier,Planten
S09000379,Cuscuta epithymum,Klein warkruid,Planten
S09000386,Cynosurus cristatus,Kamgras,Planten
S09000389,Cystopteris fragilis,Blaasvaren,Planten
S09000392,Daphne mezereum,Rood peperboompje,Planten
S09000399,Deschampsia setacea,Moerassmele,Planten
S09000402,Dianthus armeria,Ruige anjer,Planten
S09000404,Dianthus deltoides,Steenanjer,Planten
S09000416,Drosera longifolia,Lange zonnedauw,Planten
S09000417,Drosera intermedia,Kleine zonnedauw,Planten
S09000418,Drosera rotundifolia,Ronde zonnedauw,Planten
S09000429,Baldellia ranunculoides subsp. ranunculoides,Stijve moerasweegbree,Planten
S09000430,Baldellia ranunculoides subsp. repens,Kruipende moerasweegbree,Planten
S09000432,Elatine hexandra,Gesteeld glaskroos,Planten
S09000438,Eleocharis quinqueflora,Armbloemige waterbies,Planten
S09000444,Elytrigia juncea subsp. boreoatlantica,Biestarwegras,Planten
S09000456,Epilobium palustre,Moerasbasterdwederik,Planten
S09000461,Epipactis palustris,Moeraswespenorchis,Planten
S09000467,Equisetum ramosissimum,Vertakte paardenstaart,Planten
S09000471,Equisetum variegatum,Bonte paardenstaart,Planten
S09000472,Erica cinerea,Rode dophei,Planten
S09000477,Eriophorum gracile,Slank wollegras,Planten
S09000478,Eriophorum latifolium,Breed wollegras,Planten
S09000479,Eriophorum vaginatum,Eenarig wollegras,Planten
S09000481,Erodium lebelii,Kleverige reigersbek,Planten
S09000486,Eryngium maritimum,Blauwe zeedistel,Planten
S09000488,Erysimum virgatum,Stijve steenraket,Planten
S09000491,Euphorbia amygdaloides,Amandelwolfsmelk,Planten
S09000492,Euphorbia cyparissias,Cipreswolfsmelk,Planten
S09000494,Euphorbia exigua,Kleine wolfsmelk,Planten
S09000496,Euphorbia palustris,Moeraswolfsmelk,Planten
S09000497,Euphorbia paralias,Zeewolfsmelk,Planten
S09000500,Euphorbia seguieriana,Zandwolfsmelk,Planten
S09000509,Odontites vernus subsp. serotinus,Rode ogentroost,Planten
S09000524,Filago minima,Dwergviltkruid,Planten
S09000529,Fragaria vesca,Bosaardbei,Planten
S09000532,Fritillaria meleagris,Wilde kievitsbloem,Planten
S09000536,Gagea spathacea,Schedegeelster,Planten
S09000541,Galeopsis segetum,Bleekgele hennepnetel,Planten
S09000548,Cruciata laevipes,Kruisbladwalstro,Planten
S09000553,Galium pumilum,Kalkwalstro,Planten
S09000558,Genista anglica,Stekelbrem,Planten
S09000560,Genista pilosa,Kruipbrem,Planten
S09000561,Genista tinctoria,Verfbrem,Planten
S09000562,Gentianella amarella,Slanke gentiaan,Planten
S09000563,Gentianella campestris,Veldgentiaan,Planten
S09000565,Gentianella ciliata,Franjegentiaan,Planten
S09000566,Gentiana cruciata,Kruisbladgentiaan,Planten
S09000567,Gentianella germanica,Duitse gentiaan,Planten
S09000568,Gentiana pneumonanthe,Klokjesgentiaan,Planten
S09000569,Geranium columbinum,Fijne ooievaarsbek,Planten
S09000575,Geranium pyrenaicum,Bermooievaarsbek,Planten
S09000578,Geum rivale,Knikkend nagelkruid,Planten
S09000588,Gnaphalium sylvaticum,Bosdroogbloem,Planten
S09000590,Goodyera repens,Dennenorchis,Planten
S09000593,Gymnadenia conopsea,Grote muggenorchis,Planten
S09000595,Atriplex pedunculata,Gesteelde zoutmelde,Planten
S09000597,Hammarbya paludosa,Veenmosorchis,Planten
S09000603,Helictotrichon pratense,Beemdhaver,Planten
S09000608,Herminium monorchis,Honingorchis,Planten
S09000612,Hieracium lactucella,Spits havikskruid,Planten
S09000626,Hierochloe odorata,Veenreukgras,Planten
S09000633,Holosteum umbellatum,Heelbeen,Planten
S09000635,Hordeum marinum,Zeegerst,Planten
S09000637,Hordeum secalinum,Veldgerst,Planten
S09000642,Hyoscyamus niger,Bilzekruid,Planten
S09000643,Hypericum canadense,Canadees hertshooi,Planten
S09000644,Hypericum elodes,Moerashertshooi,Planten
S09000645,Hypericum hirsutum,Ruig hertshooi,Planten
S09000650,Hypericum pulchrum,Fraai hertshooi,Planten
S09000652,Hypochaeris glabra,Glad biggenkruid,Planten
S09000659,Illecebrum verticillatum,Grondster,Planten
S09000663,Inula conyzae,Donderkruid,Planten
S09000668,Isoetes echinospora,Kleine biesvaren,Planten
S09000672,Juncus alpinoarticulatus subsp. atricapillus,Duinrus,Planten
S09000681,Juncus filiformis,Draadrus,Planten
S09000686,Juncus pygmaeus,Dwergrus,Planten
S09000689,Juncus tenageia,Wijdbloeiende rus,Planten
S09000691,Juniperus communis,Jeneverbes,Planten
S09000692,Knautia arvensis,Beemdkroon,Planten
S09000695,Koeleria pyramidata,Breed fakkelgras,Planten
S09000710,Lathyrus aphaca,Naakte lathyrus,Planten
S09000711,Lathyrus linifolius,Knollathyrus,Planten
S09000713,Lathyrus nissolia,Graslathyrus,Planten
S09000719,Leersia oryzoides,Rijstgras,Planten
S09000721,Legousia speculum-veneris,Groot spiegelklokje,Planten
S09000726,Leontodon hispidus,Ruige leeuwentand,Planten
S09000734,Leucojum aestivum,Zomerklokje,Planten
S09000738,Limonium vulgare,Lamsoor,Planten
S09000742,Kickxia elatine,Spiesleeuwenbek,Planten
S09000744,Kickxia spuria,Eironde leeuwenbek,Planten
S09000747,Linum catharticum,Geelhartje,Planten
S09000748,Liparis loeselii,Groenknolorchis,Planten
S09000749,Neottia cordata,Kleine keverorchis,Planten
S09000750,Neottia ovata,Grote keverorchis,Planten
S09000751,Lithospermum arvense,Ruw parelzaad,Planten
S09000753,Littorella uniflora,Oeverkruid,Planten
S09000754,Lobelia dortmanna,Waterlobelia,Planten
S09000764,Ludwigia palustris,Waterlepeltje,Planten
S09000765,Luronium natans,Drijvende waterweegbree,Planten
S09000771,Luzula sylvatica,Grote veldbies,Planten
S09000774,Lycopodium annotinum,Stekende wolfsklauw,Planten
S09000775,Lycopodium clavatum,Grote wolfsklauw,Planten
S09000776,Lycopodium tristachyum,Kleine wolfsklauw,Planten
S09000777,Lycopodiella inundata,Moeraswolfsklauw,Planten
S09000781,Lysimachia nemorum,Boswederik,Planten
S09000800,Medicago minima,Kleine rupsklaver,Planten
S09000806,Silene noctiflora,Nachtkoekoeksbloem,Planten
S09000808,Melica uniflora,Eenbloemig parelgras,Planten
S09000817,Mentha pulegium,Polei,Planten
S09000818,Mentha suaveolens,Witte munt,Planten
S09000821,Menyanthes trifoliata,Waterdrieblad,Planten
S09000827,Milium vernale,Ruw gierstgras,Planten
S09000829,Minuartia hybrida,Tengere veldmuur,Planten
S09000834,Monotropa hypopitys,Stofzaad,Planten
S09000845,Myosotis stricta,Stijf vergeet-mij-nietje,Planten
S09000849,Myrica gale,Wilde gagel,Planten
S09000850,Myriophyllum alterniflorum,Teer vederkruid,Planten
S09000857,Nardus stricta,Borstelgras,Planten
S09000858,Narthecium ossifragum,Beenbreek,Planten
S09000861,Neottia nidus-avis,Vogelnestje,Planten
S09000862,Nepeta cataria,Wild kattenkruid,Planten
S09000870,Oenanthe lachenalii,Zilt torkruid,Planten
S09000877,Ononis repens subsp. spinosa,Kattendoorn,Planten
S09000881,Ophrys insectifera,Vliegenorchis,Planten
S09000884,Dactylorhiza incarnata,Vleeskleurige orchis,Planten
S09000886,Dactylorhiza majalis subsp. majalis,Brede orchis,Planten
S09000887,Orchis mascula,Mannetjesorchis,Planten
S09000888,Orchis militaris,Soldaatje,Planten
S09000889,Orchis morio,Harlekijn,Planten
S09000891,Orchis purpurea,Purperorchis,Planten
S09000901,Orobanche minor,Klavervreter,Planten
S09000902,Orobanche picridis,Bitterkruidbremraap,Planten
S09000903,Orobanche purpurea,Blauwe bremraap,Planten
S09000913,Vaccinium oxycoccos,Kleine veenbes,Planten
S09000917,Parapholis strigosa,Dunstaart,Planten
S09000920,Paris quadrifolia,Eenbes,Planten
S09000921,Parnassia palustris,Parnassia,Planten
S09000923,Pedicularis palustris,Moeraskartelblad,Planten
S09000924,Pedicularis sylvatica,Heidekartelblad,Planten
S09000928,Peucedanum carvifolia,Karwijvarkenskervel,Planten
S09000935,Phyteuma spicatum subsp. nigrum,Zwartblauwe rapunzel,Planten
S09000936,Phyteuma spicatum subsp. spicatum,Witte rapunzel,Planten
S09000937,Picris echioides,Dubbelkelk,Planten
S09000939,Pilularia globulifera,Pilvaren,Planten
S09000942,Pinguicula vulgaris,Vetblad,Planten
S09000948,Plantago maritima,Zeeweegbree,Planten
S09000949,Plantago media,Ruige weegbree,Planten
S09000950,Platanthera bifolia,Welriekende nachtorchis,Planten
S09000951,Platanthera montana,Bergnachtorchis,Planten
S09000961,Polygala comosa,Kuifvleugeltjesbloem,Planten
S09000962,Polygala serpyllifolia,Liggende vleugeltjesbloem,Planten
S09000963,Polygala vulgaris,Gewone vleugeltjesbloem,Planten
S09000966,Polygonatum verticillatum,Kranssalomonszegel,Planten
S09000979,Polystichum aculeatum,Stijve naaldvaren,Planten
S09000993,Potamogeton gramineus,Ongelijkbladig fonteinkruid,Planten
S09001011,Potentilla sterilis,Aardbeiganzerik,Planten
S09001013,Potentilla tabernaemontani,Voorjaarsganzerik,Planten
S09001015,Primula veris,Gulden sleutelbloem,Planten
S09001016,Primula vulgaris,Stengelloze sleutelbloem,Planten
S09001024,Puccinellia fasciculata,Blauw kweldergras,Planten
S09001033,Pyrola minor,Klein wintergroen,Planten
S09001034,Pyrola rotundifolia,Rond wintergroen,Planten
S09001038,Radiola linoides,Dwergvlas,Planten
S09001042,Ranunculus arvensis,Akkerboterbloem,Planten
S09001053,Ranunculus ololeucos,Witte waterranonkel,Planten
S09001067,Rhinanthus minor,Kleine ratelaar,Planten
S09001068,Rhynchospora alba,Witte snavelbies,Planten
S09001069,Rhynchospora fusca,Bruine snavelbies,Planten
S09001107,Ruppia maritima,Snavelruppia,Planten
S09001110,Sagina maritima,Zeevetmuur,Planten
S09001111,Sagina nodosa,Sierlijke vetmuur,Planten
S09001128,Salvia pratensis,Veldsalie,Planten
S09001130,Salvia verticillata,Kranssalie,Planten
S09001138,Sanicula europaea,Heelkruid,Planten
S09001141,Clinopodium acinos,Kleine steentijm,Planten
S09001143,Clinopodium vulgare,Borstelkrans,Planten
S09001144,Saxifraga granulata,Knolsteenbreek,Planten
S09001147,Scabiosa columbaria,Duifkruid,Planten
S09001148,Scandix pecten-veneris,Naaldenkervel,Planten
S09001149,Scheuchzeria palustris,Veenbloembies,Planten
S09001150,Schoenus nigricans,Knopbies,Planten
S09001154,Eleogiton fluitans,Vlottende bies,Planten
S09001157,Blysmus compressus,Platte bies,Planten
S09001158,Blysmus rufus,Rode bies,Planten
S09001162,Schoenoplectus triqueter,Driekantige bies,Planten
S09001164,Scleranthus perennis,Overblijvende hardbloem,Planten
S09001166,Scorzonera humilis,Kleine schorseneer,Planten
S09001174,Scutellaria minor,Klein glidkruid,Planten
S09001180,Sedum rupestre,Tripmadam,Planten
S09001181,Sedum sexangulare,Zacht vetkruid,Planten
S09001182,Selinum carvifolia,Karwijselie,Planten
S09001183,Jacobaea aquatica,Waterkruiskruid,Planten
S09001193,Serratula tinctoria,Zaagblad,Planten
S09001198,Sherardia arvensis,Blauw walstro,Planten
S09001200,Silaum silaus,Weidekervel,Planten
S09001205,Silene otites,Oorsilene,Planten
S09001222,Solidago virgaurea,Echte guldenroede,Planten
S09001228,Sparganium angustifolium,Drijvende egelskop,Planten
S09001230,Sparganium natans,Kleinste egelskop,Planten
S09001232,Spartina maritima,Klein slijkgras,Planten
S09001240,Spiranthes spiralis,Herfstschroeforchis,Planten
S09001243,Stachys arvensis,Akkerandoorn,Planten
S09001244,Stachys officinalis,Betonie,Planten
S09001253,Stellaria nemorum,Bosmuur,Planten
S09001258,Succisa pratensis,Blauwe knoop,Planten
S09001262,Taraxacum celticum,Schraallandpaardenbloem,Planten
S09001263,Taraxacum obliquum,Oranjegele paardenbloem,Planten
S09001265,Taraxacum palustre,Moeraspaardenbloem,Planten
S09001283,Thymus pulegioides,Grote tijm,Planten
S09001284,Thymus serpyllum,Kleine tijm,Planten
S09001290,Torilis nodosa,Knopig doornzaad,Planten
S09001302,Trifolium medium,Bochtige klaver,Planten
S09001303,Trifolium micranthum,Draadklaver,Planten
S09001304,Trifolium ornithopodioides,Vogelpootklaver,Planten
S09001308,Trifolium striatum,Gestreepte klaver,Planten
S09001309,Trifolium subterraneum,Onderaardse klaver,Planten
S09001312,Trisetum flavescens,Goudhaver,Planten
S09001313,Tuberaria guttata,Gevlekt zonneroosje,Planten
S09001315,Arabis glabra,Torenkruid,Planten
S09001319,Ulex europaeus,Gaspeldoorn,Planten
S09001323,Utricularia intermedia,Plat blaasjeskruid,Planten
S09001324,Utricularia minor,Klein blaasjeskruid,Planten
S09001330,Vaccinium uliginosum,Rijsbes,Planten
S09001332,Valeriana dioica,Kleine valeriaan,Planten
S09001335,Valerianella dentata,Getande veldsla,Planten
S09001354,Veronica montana,Bosereprijs,Planten
S09001356,Veronica opaca,Doffe ereprijs,Planten
S09001361,Veronica prostrata,Liggende ereprijs,Planten
S09001364,Veronica austriaca subsp. teucrium,Brede ereprijs,Planten
S09001365,Veronica triphyllos,Handjesereprijs,Planten
S09001379,Viola lutea subsp. calaminaria,Zinkviooltje,Planten
S09001380,Viola canina,Hondsviooltje,Planten
S09001386,Viola reichenbachiana,Donkersporig bosviooltje,Planten
S09001389,Viola persicifolia,Melkviooltje,Planten
S09001415,Polypodium interjectum,Brede eikvaren,Planten
S09001454,Alchemilla glabra,Kale vrouwenmantel,Planten
S09001460,Caltha palustris subsp. araneosa,Spindotterbloem,Planten
S09001473,Festuca ovina,Genaald schapengras,Planten
S09001610,Bromus racemosus,Trosdravik,Planten
S09001616,Dactylorhiza maculata,Gevlekte orchis,Planten
S09001923,Helianthemum nummularium,Geel zonneroosje,Planten
S09001953,Thalictrum minus,Kleine ruit,Planten
S09002316,Euphrasia stricta s.l.,Stijve ogentroost,Planten
S09002417,Hieracium murorum,Muurhavikskruid,Planten
# MNP Species tabel. Gebaseerd op w:\PROJECTS\qmar\MNP-SNL-ParameterSet\Parameters_v06_2019_12_09\08_MNP_versie4_par_taxonomic_group.csv en W:\PROJECTS\QMAR\MNP-SNL-ParameterSet\Parameters_v06_2019_12_09\01_Base_species_name.csv
# Door: Hans Roelofsen, 11/Jan/2022 17:46
Species_code,Scientific_name,Local_name,taxon,sel468,sel281,sel1018,sel146,selall
S02000020,Gavia stellata,Roodkeelduiker,V,0,0,1,0,1
S02000030,Gavia arctica ssp. arctica,Parelduiker,V,0,0,1,0,1
S02000070,Tachybaptus ruficollis,Dodaars,V,1,0,1,0,1
S02000110,Podiceps auritus,Kuifduiker,V,0,0,1,0,1
S02000120,Podiceps nigricollis,Geoorde fuut,V,1,0,1,1,1
S02000550,Oceanodroma leucorhoa ssp. leucorhoa,Vaal stormvogeltje,V,0,0,1,0,1
S02000720,Phalacrocorax carbo,Aalscholver,V,0,0,1,0,1
S02000950,Botaurus stellaris,Roerdomp,V,1,0,1,0,1
S02000980,Ixobrychus minutus,Woudaap,V,1,0,1,0,1
S02001040,Nycticorax nycticorax,Kwak,V,1,0,1,1,1
S02001190,Egretta garzetta,Kleine zilverreiger,V,0,0,1,0,1
S02001210,Casmerodius albus,Grote zilverreiger,V,1,0,1,0,1
S02001240,Ardea purpurea,Purperreiger,V,1,0,1,0,1
S02001310,Ciconia nigra,Zwarte ooievaar,V,0,0,1,0,1
S02001340,Ciconia ciconia ssp. ciconia,Ooievaar,V,1,0,1,0,1
S02001440,Platalea leucorodia,Lepelaar,V,1,0,1,0,1
S02001730,Tadorna tadorna,Bergeend,V,1,0,1,1,1
S02001820,Anas strepera,Krakeend,V,1,0,1,0,1
S02001840,Anas crecca,Wintertaling,V,1,0,1,1,1
S02001890,Anas acuta ssp. acuta,Pijlstaart,V,1,0,1,0,1
S02001910,Anas querquedula,Zomertaling,V,1,0,1,0,1
S02001940,Anas clypeata,Slobeend,V,1,0,1,0,1
S02001960,Netta rufina,Krooneend,V,1,0,1,0,1
S02002030,Aythya fuligula,Kuifeend,V,1,0,1,0,1
S02002040,Aythya marila,Topper,V,0,0,1,0,1
S02002060,Somateria mollissima,Eider,V,1,0,1,1,1
S02002200,Mergellus albellus,Nonnetje,V,0,0,1,0,1
S02002210,Mergus serrator,Middelste zaagbek,V,0,0,1,0,1
S02002230,Mergus merganser ssp. merganser,Grote zaagbek,V,0,0,1,0,1
S02002310,Pernis apivorus,Wespendief,V,1,0,1,1,1
S02002380,Milvus migrans ssp. migrans,Zwarte wouw,V,0,0,1,0,1
S02002390,Milvus milvus ssp. milvus,Rode wouw,V,0,0,1,0,1
S02002430,Haliaeetus albicilla,Zeearend,V,0,0,1,0,1
S02002600,Circus aeruginosus,Bruine kiekendief,V,1,0,1,0,1
S02002610,Circus cyaneus,Blauwe kiekendief,V,1,0,1,0,1
S02002630,Circus pygargus,Grauwe kiekendief,V,1,0,1,0,1
S02002670,Accipiter gentilis ssp. gentilis,Havik,V,1,0,1,0,1
S02002870,Buteo buteo ssp. buteo,Buizerd,V,1,0,1,0,1
S02003010,Pandion haliaetus,Visarend,V,0,0,1,0,1
S02003040,Falco tinnunculus ssp. tinnunculus,Torenvalk,V,1,0,1,0,1
S02003090,Falco columbarius ssp. aesalon,Smelleken,V,0,0,1,0,1
S02003200,Falco peregrinus ssp. peregrinus,Slechtvalk,V,0,0,1,0,1
S02003320,Tetrao tetrix,Korhoen,V,1,0,1,0,1
S02003670,Perdix perdix,Patrijs,V,1,0,1,0,1
S02003700,Coturnix coturnix,Kwartel,V,1,0,1,0,1
S02004070,Rallus aquaticus,Waterral,V,1,0,1,0,1
S02004080,Porzana porzana,Porseleinhoen,V,1,0,1,0,1
S02004100,Porzana parva,Klein waterhoen,V,1,0,1,0,1
S02004110,Porzana pusilla,Kleinst waterhoen,V,1,0,1,0,1
S02004210,Crex crex,Kwartelkoning,V,1,0,1,0,1
S02004330,Grus grus,Kraanvogel,V,1,0,1,0,1
S02004500,Haematopus ostralegus,Scholekster,V,1,0,1,0,1
S02004560,Recurvirostra avosetta,Kluut,V,1,0,1,1,1
S02004590,Burhinus oedicnemus ssp. oedicnemus,Griel,V,1,0,1,0,1
S02004690,Charadrius dubius,Kleine plevier,V,1,0,1,0,1
S02004700,Charadrius hiaticula,Bontbekplevier,V,1,0,1,0,1
S02004770,Charadrius alexandrinus,Strandplevier,V,1,0,1,1,1
S02004820,Charadrius morinellus,Morinelplevier,V,0,0,1,0,1
S02004850,Pluvialis apricaria,Goudplevier,V,0,0,1,0,1
S02004860,Pluvialis squatarola,Zilverplevier,V,0,0,1,0,1
S02004930,Vanellus vanellus,Kievit,V,0,0,1,0,1
S02004960,Calidris canutus ssp. islandica,Groenlandse kanoet,V,0,0,1,0,1
S02005120,Calidris alpina ssp. alpina,Bonte strandloper,V,0,0,1,0,1
S02005170,Philomachus pugnax,Kemphaan,V,1,0,1,0,1
S02005190,Gallinago gallinago,Watersnip,V,1,0,1,1,1
S02005290,Scolopax rusticola,Houtsnip,V,0,0,1,0,1
S02005320,Limosa limosa,Grutto,V,1,0,1,0,1
S02005340,Limosa lapponica ssp. lapponica,Rosse grutto,V,0,0,1,0,1
S02005410,Numenius arquata,Wulp,V,1,0,1,1,1
S02005460,Tringa totanus,Tureluur,V,1,0,1,1,1
S02005540,Tringa glareola,Bosruiter,V,0,0,1,0,1
S02005640,Phalaropus lobatus,Grauwe franjepoot,V,0,0,1,0,1
S02005750,Larus melanocephalus,Zwartkopmeeuw,V,1,0,1,0,1
S02005780,Larus minutus,Dwergmeeuw,V,0,0,1,0,1
S02005900,Larus canus ssp. canus,Stormmeeuw,V,0,0,1,0,1
S02005912,Larus fuscus ssp. intermedius,Kleine mantelmeeuw,V,0,0,1,0,1
S02006060,Sterna caspia,Reuzenstern,V,0,0,1,0,1
S02006110,Sterna sandvicensis,Grote stern,V,1,0,1,0,1
S02006150,Sterna hirundo,Visdief,V,1,0,1,0,1
S02006160,Sterna paradisaea,Noordse stern,V,1,0,1,0,1
S02006240,Sterna albifrons,Dwergstern,V,1,0,1,0,1
S02006270,Chlidonias niger ssp. niger,Zwarte stern,V,1,0,1,0,1
S02007350,Tyto alba ssp. guttata,Kerkuil,V,0,0,1,0,1
S02007570,Athene noctua ssp. vidalii,Steenuil,V,0,0,1,0,1
S02007610,Strix aluco,Bosuil,V,0,0,1,0,1
S02007680,Asio flammeus,Velduil,V,1,0,1,1,1
S02007780,Caprimulgus europaeus ssp. europaeus,Nachtzwaluw,V,1,0,1,0,1
S02008310,Alcedo atthis ssp. ispida,IJsvogel,V,1,0,1,0,1
S02008460,Upupa epops ssp. epops,Hop,V,0,0,1,0,1
S02008480,Jynx torquilla,Draaihals,V,1,0,1,0,1
S02008560,Picus viridis,Groene specht,V,1,0,1,0,1